Jurusan Proteksi Tanaman atau yang juga disebut dengan Jurusan Ilmu Hama dan Penyakit Tumbuhan adalah program studi yang fokus pada isu pengelolaan hama untuk mengkonservasi lingkungan serta memanajemen sumberdaya hayati dalam rangka untuk memelihara keseimbangan agroekosistem. Secara umum jurusan ini mempelajari tentang pengamanan produksi pertanian melalui manajemen kesehatan tanaman. Sehingga di jurusan ini para mahasiswa dituntut untuk memahami berbagai jenis hama tanaman, mengetahui nama latinnya, jenis, dan juga gejala penyakit tanaman yang disebabkan oleh virus, kemudian bagaimana cara mengendalikannya.