Jurusan Kedokteran Spesialis ini bertujuan untuk menghasilkan para dokter spesialis yang memiliki pengetahuan, keterampilan, dan juga sikap yang profesional sehingga mampu untuk memecahkan masalah secara ilmiah dan bisa mengamalkan ilmunya kepada masyarakat sesuai dengan bidang spesialisasinya secara optimal. Umumnya, Jurusan Kedokteran Spesialis atau Program Pendidikan Dokter Spesialis ini merupakan tahapan lanjut pendidikan seorang dokter untuk menjadi spesialis.