Untuk mengatasi kelemahan muatan nilai dalam PAI,pemerintah telah memberikan peluang yang cukup luas bagi guru untuk mengurai muatan dan proses pembelajaran PAI melalui Kurikulum Tingkat Satuan Pendidikan (KTSP), Melalui KTSP ini kegiatan belajar mengajar PAI perlu dipikirkan kembali,dirancang ulang,dan dilakukan analisis kebutuhan berdasarkan tuntutan yang berkembang.Dasr pengembangan kegiatan belajar mengajr PAI harus tetap mengacu pada prinsip,strategi,dan struktur yang berbasis kompetensi,seperti yang tercantum dalam KTSP.