Yukito Ayatsuji adalah detektif jenius yang mampu melihat kebenaran di balik kasus pembunuhan. Dengan kemampuan supranaturalnya, dia bisa membuat pelaku tewas dalam kecelakaan sehingga dijuluki “Detektif Pembunuh”. Akibat julukannya, Mizuki Tsujimura, agen baru Divisi Khusus Kemampuan Supranatural, ditugaskan untuk mengawasinya. Namun, Ayatsuji selalu mempermainkannya lewat kecerdasan dan mulutnya yang tajam. Suatu hari, keduanya diminta pemerintah untuk memecahkan teka-teki kasus pembunuhan yang janggal. Penyelidikan itu pun menjadi awal pertarungan mereka melawan Sang Penyihir Natsuhiko Kyogoku, musuh bebuyutan Ayatsuji sekaligus ancaman bagi masyarakat.