Holy Grail War yang penuh kepalsuan dimuali di Snowfield, Amerika Barat. Adu serangan mematikan antara Gilgamesh dan sahabatnya, Enkidu, menjadi sinyal dimualinya pertempuran. Sementara itu, di sebuah tempat bernama Fuyuki, beredar kisah hantu tentang "Gadis Bertuudng Merah Apartemen Semina". Protagonis kisah tersebut, Ayaka Sajou, telah tiba di Snowdield. Di hadapan wanita yang diteror Gadis Bertudung Merah itu, seorang kesatria yang menyebut dirinya "Saber" pun muncul. Partisipasi Servant misterius yang bahkan tidak dikenali dalang Holy Grail War kali ini membuat situasi makin kacau...